نقطة للجينوميات
العودة إلى أطلس نقطة →

مراجَع تحريريًا · ae-ghaf-population-genomics-2025

UAE Ghaf Population Genomics Study

الإماراتBiodiversity, conservation and evolutionCompleted / retained

Population-scale whole-genome resequencing of Ghaf trees collected across the UAE to characterize population structure, genetic diversity, differentiation and gene flow for conservation, seed banking and climate-resilient restoration.

01 / نظرة عامة على المشروع

ما الذي يثبته السجل.

النطاق الجغرافي
Natural Ghaf populations sampled across the UAE
نوع المشروع
population genomics and conservation genomics study
مجال البحث
plant population genomics, conservation genetics, climate adaptation and restoration
السنوات
2025–2025
حالة المشروع
completed research study
أساس تحديد الحالة
Peer-reviewed publication in September 2025 and official EAD/ICBA completion announcements in November 2025.
تاريخ دليل الحالة
2025-11-28
الحجم
211 trees sequenced; 204 passed quality filtering; 114 non-clonal individuals used for structure analyses; 57,183 LD-pruned SNPs; four major genetic clusters.

02 / المؤسسات والمجتمع

من وما الذي يربطه المشروع.

الجهات القائدة
International Center for Biosaline Agriculture · Environment Agency - Abu Dhabi
الجهات الشريكة
غير مذكور
الكائن / المجتمع
Ghaf tree (Prosopis cineraria)

03 / البيانات والإتاحة

ما الموجود وكيف يمكن الوصول إليه.

أنواع البيانات

  • DNBSEQ-G400RS whole-genome resequencing
  • population SNP genotypes
  • VCF
  • sample geospatial metadata
  • population structure and differentiation outputs

إتاحة البيانات

Raw whole-genome reads are reported as public through ENA/INSDC PRJEB82449; derived VCFs, sample metadata and population-genomics outputs are archived on Zenodo at DOI 10.5281/zenodo.15716843.

المعرّفات

  • DOI10.3390/plants14192970
  • PMID41095111
  • PMCIDPMC12526342
  • ENAPRJEB82449
  • DOI10.5281/zenodo.15716843

04 / الدليل والمصدر

لماذا أُدرج هذا السجل.

أساس الإدراج

Distinct, completed UAE population-genomics study with peer-reviewed publication, official institutional confirmation, and durable public raw/derived genomic-data identifiers.

ملاحظة تحريرية

Keep distinct from ae-ghaf-tree-genome (EAD-M42 reference genome/methylation project) and ae-native-plant-genome-sequencing (EAD-M42 12-species programme). The publication states that an existing Prosopis cineraria reference genome enabled the analysis, but Batch 005 does not assert a direct Atlas relationship until the cited reference assembly/project is explicitly reconciled.

المصادر

  1. peer-reviewed publication تم التحقق في 2026-09-05
  2. peer-reviewed publication تم التحقق في 2026-09-05
  3. data repository تم التحقق في 2026-09-05
  4. official or institutional source تم التحقق في 2026-09-05
  5. official or institutional source تم التحقق في 2026-09-05

سجلات مرتبطة في الأطلس

الإصدار v0.3.0

خذ السجل العام معك.