نقطة للجينوميات
العودة إلى أطلس نقطة →

مراجَع تحريريًا · sa-public-pangenome

A Public Saudi Pangenome as Reference for Genomics in the Middle East

السعوديةHuman health and population genomicsActive / operational

Uses long- and short-read sequencing to build phased Saudi assemblies and graph references that reduce reference bias and improve variant interpretation in Middle Eastern genomes.

01 / نظرة عامة على المشروع

ما الذي يثبته السجل.

النطاق الجغرافي
Genetically and geographically diverse Saudi regions and tribes
نوع المشروع
Population pangenome and reference-genomics project
مجال البحث
Population genomics, structural variation and reference bias
السنوات
2024–2026
حالة المشروع
active
أساس تحديد الحالة
The formal KAUST project runs from 2024 through 2026; a major JaSaPaGe pangenome output was published in 2025.
تاريخ دليل الحالة
2026-08-15
الحجم
Formal goal of at least 10 diploid assemblies. JaSaPaGe released nine Saudi genomes (eight newly sequenced plus KSA001) alongside ten Japanese genomes.

02 / المؤسسات والمجتمع

من وما الذي يربطه المشروع.

الجهات القائدة
King Abdullah University of Science and Technology (KAUST)
الجهات الشريكة
KAUST Smart Health Initiative · KAUST Bioscience Core Laboratory · Saudi clinical partners · Japanese JaSaPaGe collaborators
الكائن / المجتمع
Saudi individuals selected for geographic and tribal diversity

03 / البيانات والإتاحة

ما الموجود وكيف يمكن الوصول إليه.

أنواع البيانات

  • PacBio HiFi
  • Oxford Nanopore
  • Hi-C
  • Illumina sequencing
  • phased assemblies
  • pangenome graphs

إتاحة البيانات

Public raw reads, assemblies, graphs and workflows

المعرّفات

  • BioProjectPRJNA1091214
  • BioProjectPRJNA891101

04 / الدليل والمصدر

لماذا أُدرج هذا السجل.

أساس الإدراج

Funded national-reference project with public multi-platform sequence data and a peer-reviewed pangenome release.

ملاحظة تحريرية

JaSaPaGe is a project output/phase, not another Saudi initiative. KSA001 is a precursor/included sample. The formal target and current released count use different denominators.

المصادر

  1. primary record source تم التحقق في 2026-08-15
  2. additional record source تم التحقق في 2026-08-15
  3. additional record source تم التحقق في 2026-08-15
  4. additional record source تم التحقق في 2026-08-15

سجلات مرتبطة في الأطلس

الإصدار v0.2.0

خذ السجل العام معك.