العودة إلى أطلس نقطة →
مراجَع تحريريًا · sa-ksa001
KSA001 Saudi Reference Genome
Produced the first publicly available reference-quality phased diploid/near-telomere-to-telomere genome for a Saudi individual.
01 / نظرة عامة على المشروع
ما الذي يثبته السجل.
- النطاق الجغرافي
- One Saudi trio recruited at King Fahad Medical City
- نوع المشروع
- Population reference genome dataset
- مجال البحث
- Reference genomics and population variation
- السنوات
- 2022–2024
- حالة المشروع
- completed
- أساس تحديد الحالة
- Recruitment occurred in 2022-2023; the phased reference-quality assembly and public data were published in 2024.
- تاريخ دليل الحالة
- 2024-11-28
- الحجم
- One index genome plus parental data; public raw reads, assemblies and code. Use of KSA001 as reference reduces called variants by more than one million per genome relative to GRCh38 in reported analyses.
02 / المؤسسات والمجتمع
من وما الذي يربطه المشروع.
- الجهات القائدة
- King Abdullah University of Science and Technology (KAUST) · King Fahad Medical City
- الجهات الشريكة
- غير مذكور
- الكائن / المجتمع
- One Saudi adult and both parents
03 / البيانات والإتاحة
ما الموجود وكيف يمكن الوصول إليه.
أنواع البيانات
- PacBio HiFi
- Oxford Nanopore
- Hi-C
- Illumina sequencing
- phased de novo assembly
إتاحة البيانات
Public
المعرّفات
- BioProject
PRJNA891101
04 / الدليل والمصدر
لماذا أُدرج هذا السجل.
أساس الإدراج
Named public reference dataset and direct precursor to a national pangenome, despite its single-index scale.
ملاحظة تحريرية
KSA001 is incorporated into the Saudi pangenome/JaSaPaGe resource; do not count its index individual again as a newly recruited pangenome participant.
المصادر
- primary record source تم التحقق في 2026-08-15
- additional record source تم التحقق في 2026-08-15
- additional record source تم التحقق في 2026-08-15
الإصدار v0.2.0
