العودة إلى أطلس نقطة →

سجل مستودعي · ncbi-prjna1449514

Pseudomonas sp. FA-1 Genome sequencing

السعوديةPathogen genomics and infectious diseaseRepository record

Whole genome sequencing of a tick-associated Pseudomonas sp. isolated from Hyalomma dromedarii ticks collected from camels at Hail Province, Saudi Arabia. Average nucleotide identity analysis (87.5% to the closest relative, P. guariconensis type strain LMG 27394) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH 32.9%) indicate this isolate represents a potentially novel genomospecies within the P. putida group. The genome was assembled using SPAdes from Illumina paired-end reads, yielding a 5.1 Mb draft genome (38 contigs at 500 bp or greater, N50 363 kb, GC 63.75%). Annotation by Prokka identified 4,541 protein-coding genes, 77 tRNAs, and 5 rRNAs. AMR screening detected only intrinsic efflux pump genes (MexAB-OprM, MexCD-OprJ, MexEF-OprN) with no acquired resistance determinants. This project supports characterization of tick-associated bacteria and antimicrobial resistance surveillance in arthropod vectors from Saudi Arabia.

تفسير سجل المستودع

تم التحقق من رقم الوصول وارتباطه بدولة خليجية. ولا يثبت التسجيل وحده أن البرنامج البحثي الأوسع ما زال نشطًا.

01 / نظرة عامة على المشروع

ما الذي يثبته السجل.

النطاق الجغرافي
Saudi Arabia connection indexed in BioProject metadata
نوع المشروع
Repository project
مجال البحث
Pathogen genomics and infectious disease
السنوات
2026–
حالة المشروع
repository_recorded
أساس تحديد الحالة
Registered in NCBI BioProject on 2026/04/06; operational lifecycle is not asserted.
تاريخ دليل الحالة
2026-04-06
الحجم
1 BioProject accession grouped by matching submitter, date, data type and narrative.

02 / المؤسسات والمجتمع

من وما الذي يربطه المشروع.

الجهات القائدة
King Saud University
الجهات الشريكة
غير مذكور
الكائن / المجتمع
Pseudomonas sp. FA-1

03 / البيانات والإتاحة

ما الموجود وكيف يمكن الوصول إليه.

أنواع البيانات

  • Genome sequencing
  • Sequencing
  • Genome

إتاحة البيانات

Public repository metadata with linked data where supplied by the submitter

المعرّفات

  • BioProjectPRJNA1449514

04 / الدليل والمصدر

لماذا أُدرج هذا السجل.

أساس الإدراج

Exact country-name match in authoritative NCBI BioProject metadata; repeated submissions are grouped into one Atlas series.

ملاحظة تحريرية

Repository verification confirms the accession and regional connection, not whether the broader research programme remains active.

المصادر

  1. primary record source تم التحقق في 2026-08-15

الإصدار v0.2.0

خذ السجل العام معك.