نقطة للجينوميات
العودة إلى أطلس نقطة →

مراجَع تحريريًا · gcc-uae-arab-pangenome

UAE-Based Arab Pangenome Reference

السعوديةالإماراتعُمانHuman health and population genomicsCompleted / retained

Built 106 haplotype-resolved assemblies and nuclear and mitochondrial pangenomes from PacBio HiFi, Oxford Nanopore ultralong and Hi-C data.

01 / نظرة عامة على المشروع

ما الذي يثبته السجل.

النطاق الجغرافي
UAE-based cohort with participants originating from UAE, Saudi Arabia, Oman and five non-GCC Arab countries
نوع المشروع
Regional pangenome reference
مجال البحث
Human pangenomics and genomic medicine
السنوات
غير مذكور
حالة المشروع
completed
أساس تحديد الحالة
The reference, public files, code and primary paper were released in 2025.
تاريخ دليل الحالة
2025-07-24
الحجم
53 participants; 111.96 Mb of sequence absent from existing references, 8.94 million population-specific small variants and 235,195 structural variants reported.

02 / المؤسسات والمجتمع

من وما الذي يربطه المشروع.

الجهات القائدة
Mohammed Bin Rashid University of Medicine and Health Sciences · Dubai Health · Dubai Health Center for Applied and Translational Genomics
الجهات الشريكة
غير مذكور
الكائن / المجتمع
53 healthy Arab residents of the UAE, including 50 unrelated adults and one trio

03 / البيانات والإتاحة

ما الموجود وكيف يمكن الوصول إليه.

أنواع البيانات

  • PacBio HiFi
  • Oxford Nanopore ultralong reads
  • Hi-C
  • de novo assemblies
  • pangenome graphs
  • VCF
  • PacBio HiFi sequencing
  • Oxford Nanopore ultralong sequencing
  • phased assemblies
  • pangenome graph
  • small and structural variants

إتاحة البيانات

Open assemblies, pangenome files, VCF and code; raw reads in SRA

المعرّفات

  • BioProjectPRJNA1108179
  • Sequence studySRP509490
  • BioProject rangePRJNA1151091-PRJNA1151118
  • BioProject rangePRJNA1152014-PRJNA1152091
  • PubMedPMID:40707445
  • DOIDOI:10.1038/s41467-025-61645-w
  • DOI10.5281/zenodo.13755057

04 / الدليل والمصدر

لماذا أُدرج هذا السجل.

أساس الإدراج

Open regional reference with multi-GCC participants, durable repository accessions and reproducible code.

ملاحظة تحريرية

UAE-led; likely duplicated in the UAE country inventory and should be merged by DOI/accession. Not the same as the Emirati-only T2T pangenome or the Emirati Reference Genome Platform. All participants resided in the UAE but represented UAE, Saudi, Omani, Jordanian, Egyptian, Moroccan, Syrian, and Yemeni backgrounds.

المصادر

  1. primary record source تم التحقق في 2026-08-15
  2. additional record source تم التحقق في 2026-08-15
  3. additional record source تم التحقق في 2026-08-15
  4. additional record source تم التحقق في 2026-08-15
  5. additional record source تم التحقق في 2026-08-15
  6. additional record source تم التحقق في 2026-08-15
  7. additional record source تم التحقق في 2026-08-15
  8. additional record source تم التحقق في 2026-08-15

الإصدار v0.2.0

خذ السجل العام معك.