العودة إلى أطلس نقطة →

سجل مستودعي · ncbi-prjna1308154

Protists from Qatar soils

قطرEnvironmental and microbial genomicsRepository record

This study investigates eukaryotic biodiversity in arid and saline soil habitats across southern Qatar using environmental DNA (eDNA) metabarcoding. A total of 100 soil samples were collected from five sites representing two habitat types: Rawdha (fertile depressions) and Sabkha (saline flats). Soil sampling was conducted following a rain event in December 2018, and eDNA was extracted using the DNeasy PowerSoil Kit (Qiagen). The V4 region of the 18S rRNA gene was amplified using the primer pair 574*f/1132R and sequenced on an Illumina platform. Amplicon sequence variants (ASVs) were generated using the DADA2 pipeline and assigned taxonomic identities using the PR2 database. This dataset contributes to the understanding of microeukaryotic diversity in extreme desert environments. Huber, Carla SR, Luciano K. Huber, Sara H. Alhadidi, Talaat Ahmed, Sakeenah Adenan, Jane Oja, Amjad M. Shraim et al. "Diversity of protists in dryland habitats of Qatar revealed by environmental metabarcoding." European Journal of Protistology (2025): 126168. https://doi.org/10.1016/j.ejop.2025.126168

تفسير سجل المستودع

تم التحقق من رقم الوصول وارتباطه بدولة خليجية. ولا يثبت التسجيل وحده أن البرنامج البحثي الأوسع ما زال نشطًا.

01 / نظرة عامة على المشروع

ما الذي يثبته السجل.

النطاق الجغرافي
Qatar connection indexed in BioProject metadata
نوع المشروع
Repository project
مجال البحث
Environmental and microbial genomics
السنوات
2025–
حالة المشروع
repository_recorded
أساس تحديد الحالة
Registered in NCBI BioProject on 2025/08/19; operational lifecycle is not asserted.
تاريخ دليل الحالة
2025-08-19
الحجم
1 BioProject accession grouped by matching submitter, date, data type and narrative.

02 / المؤسسات والمجتمع

من وما الذي يربطه المشروع.

الجهات القائدة
Pontifical Catholic University of Rio Grande do Sul
الجهات الشريكة
غير مذكور
الكائن / المجتمع
Not stated

03 / البيانات والإتاحة

ما الموجود وكيف يمكن الوصول إليه.

أنواع البيانات

  • Raw sequence reads
  • Sequencing
  • Genome

إتاحة البيانات

Public repository metadata with linked data where supplied by the submitter

المعرّفات

  • BioProjectPRJNA1308154

04 / الدليل والمصدر

لماذا أُدرج هذا السجل.

أساس الإدراج

Exact country-name match in authoritative NCBI BioProject metadata; repeated submissions are grouped into one Atlas series.

ملاحظة تحريرية

Repository verification confirms the accession and regional connection, not whether the broader research programme remains active.

المصادر

  1. primary record source تم التحقق في 2026-08-15

الإصدار v0.2.0

خذ السجل العام معك.